在一项新的研究中，来自伦敦大学学院、牛津大学和哥伦比亚大学的研究人员开发出一种进行转录组学分析的新方法，并利用它揭示了小鼠中35种神经元亚型的特性。相关研究结果于2022年7月6日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“A transcriptomic axis predicts state modulation of cortical interneurons”。
生物科学家的目标之一是了解大脑如何在其他动物和人类中发挥作用。考虑到大脑的复杂性，这个目标肯定是雄心勃勃的。但是，科学家们认为，这可以通过开展各种循序渐进的研究来完成，这些研究旨在解释特定大脑的各个部分，描述它们的作用。这项新研究的一部分涉及构建一个脑细胞类型和亚型的目录。
细胞类型分类的一个方面涉及破译和记录全部表达的基因---这一过程被称为转录组学。由此可以确定每个单独的基因在大脑回路中发挥的作用。为此，科学家们使用了各种技术来进行转录组学（必须在活体组织上进行）分析，以了解更多关于大脑区域的情况，如小鼠视觉皮层。
利用coppaFISH检测72个基因。图片来自Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-04915-7。
在这项新的研究中，这些作者开发出一种新的方法来开展这样的研究工作--他们称之为coppaFISH，它能够从薄薄的脑组织切片中一次确定72个基因的表达。它涉及将体内双光子钙成像与传统的转录组学方法相结合。然后，由此产生的基因表达谱可用于将转录组映射到细胞身份上。
这些作者使用这种技术获得了1090个中间神经元（涉及35种神经元亚型）的新数据。在这样做的过程中，他们发现某些转录组原则可以用来预测其他细胞类型的活动，从而形成一个与某些类型的细胞特性相关的转录组轴。他们指出他们的技术也可用于大脑的其他区域。（生物谷 Bioon.com）
